Fennikel er en allsidig grønnsak med en mild og søtlig smak som minner om anis. Den kan brukes rå i salater for en sprø og frisk tekstur, eller tilberedes ved grilling, damping, steking eller baking for en mykere konsistens og søtere smak. Fennikel passer perfekt som tilbehør til fisk, kjøtt og kylling, og er også et spennende tilskudd i supper, gratenger og pastaretter. Fennikelbladene kan brukes som garnityr eller som smakstilsetning i dressinger og sauser.

Fennikel oppbevares best i kjøleskapet, pakket inn i en plastpose eller en lufttett beholder for å bevare friskheten. Den holder seg sprø og fersk i opptil en uke. Hvis den er skåret opp, bør den brukes innen 2–3 dager. For lengre lagring kan fennikel fryses etter å ha blitt forvellet i noen minutter, og den er da klar til bruk i varme retter som supper og gryteretter.